A melhor época para conhecer Alter do Chão é o ano inteiro. De Fevereiro a Julho temos a estação da chuvas, quando o rio está cheio e a biodiversidade é mais abundante. Igapós e Igarapés se espalham por todas as margens e a floresta se torna um lindo rio. Entre Agosto e Janeiro as chuvas diminuem bastante e as praias de areia branca surgem nas margens do rio Tapajós e seus afluentes. Em Setembro acontece a festa do Sairé, quando os botos Tucuxi e Cor de Rosa se enfrenta na arena com danças, musicas e muito adereço. É um verdadeiro Carnaval no meio da floresta amazônica.